O Programa de Pós-graduação em Filosofia da UnB foi criado em 1999, com o curso de mestrado acadêmico. Inicialmente, sua área de concentração era Teoria do Conhecimento, dado o número expressivo de pesquisadores dedicados a questões de filosofia teórica no Departamento de Filosofia à época.

Desde 2003, porém, ampliou-se o escopo das pesquisas desenvolvidas no Programa e a área de concentração passou simplesmente a ser “Filosofia”, especificando-se atualmente em cinco linhas de pesquisa: 1) Teoria do Conhecimento e Filosofia da Ciência; 2) Linguagem, Lógica e Filosofia da Mente; 3) Ética e Filosofia Política; 4) Filosofia Antiga e Medieval; 5) Filosofia da Religião. Em 2006, por decisão de órgãos superiores da UnB, os cursos de especialização em Filosofia passaram a integrar o programa também.
O PPG-FIL conta hoje com doze professores credenciados. Além da infra-estrutura geral da UnB, o programa tem investido fortemente na aquisição de material bibliográfico impresso e on-line, e em todo equipamento necessário para o desenvolvimento dos projetos de seus membros (docentes e discentes). Todo esse esforço e o ambiente de trabalho voltado para a pesquisa filosófica de qualidade tem em vista construir uma pós-graduação em Filosofia de excelência acadêmica.